آیت‌الله العظمی سیستانی اخیرا در پاسخ به سوالی درباره تحصیل فلسفه توسط طلاب، آنان را به آیت‌الله اعرافی، مدیر حوزه‌های علمیه سراسر کشور ارجاع دادند.

ایشان فرمودند: اینکه آیا امروز طلاب فلسفه بخوانند یا خیر؟ بنده را در نفی یا اثبات قرار ندهید؛ ولی خود آقایان قم و حوزه علمیه قم می دانستند که چه مقدار برای طلاب مفید است و چه مقدار را نخوانند.

حضرت آیت الله سیستانی اظهار داشتند: شخص آقای اعرافی که تازه مدیر حوزه های علمیه شده و می دانم که آقا (مقام معظم رهبری) تذکراتی را نیز برای ایشان نوشته اند، خوب است ایشان نظر بدهند چه بخوانند و چه نخوانند.